萬華龍山寺分為6個殿
分別為大殿 聖母殿 文昌殿 跟帝君殿 華陀殿與月老殿
首先 一進廟門 最前面的桌上供奉著3尊站身佛像
分別為 釋迦牟尼佛 (娑婆世界教主是佛教的創始人)藥師佛(東方琉璃世界的教主身染疾病可以向他祈求) 阿彌陀佛(西方極樂世界教主可向其祈求已故親人往生極樂世界) 是為三寶佛
大殿
在進入大殿 主尊供奉 觀世音菩薩 龍邊 文殊師利菩薩 9大羅漢 虎邊 普賢菩薩 9大羅漢 大殿之上還是有3寶佛
觀世音菩薩:與中華民族最親近的菩薩 古有云家家阿彌陀戶戶觀世音可見中華民族對觀音菩薩的信奉度之高！任何願望只要是不傷天害理的都可以像菩薩祈求因為菩薩千處祈求千處應有求必應的！
文殊師利菩薩:菩薩有如般若般浩瀚的智慧又有一把智慧之劍可以賜與智慧與道教的文昌帝君一樣！
普賢菩薩:普賢菩薩又稱大願王也是很慈悲的菩薩！
聖母殿:
天上聖母與千順將軍:為航海之神與觀世音菩薩一樣身受台灣人得敬奉！現在很多台灣人也是只要有事情就跟聖母祈求聖母也是靈驗無比以非過往的航海之神已經是萬能之神！
太陽太陰星君:為日月的崇拜
聖母殿龍邊:
水仙尊王:為大禹 屈原 李白等跟水有關係的神祇都可以稱呼為水仙尊王大部分單獨供奉水官大帝禹為水仙尊王守護河海
城隍爺文武判:城隍本為城池的崇拜後來被認為是公正無私的審判神凡往生的人都要先到各縣市城隍那報到後再送往第一殿開始審判
土地公:社神的信仰台灣人認為田頭田尾都有土地公在守護可以賜與財富與豐收可專門帶領往生者到城隍爺那報到
聖母殿虎邊:
註生娘娘 十二婆姐:龍山寺供奉的註生娘娘為 瓊霄 碧霄 雲霄 他們三位是趙天君的三個妹妹被姜子牙封為註生娘娘為掌管生育之神 １２婆姐為順天聖母得３６個婆姐中得其中１２個與註生娘娘 順天聖母 都是生育之神 與護育之神專門照顧小孩
池頭夫人：為地獄掌管血池的神尊相傳難產死亡的婦女都要浸血池，陽世親人會請法師請池頭夫人做主牽血臟 來拔度難產死亡的親人們
文昌殿：
供奉 文昌帝君 至聖先師 紫陽夫子 魁斗星君 這些都是管理功名的神尊很多學子都會前來祈求學業進步金榜提名
華陀殿：
供奉華陀先師主管醫藥很多人會向他祈求治癒疾病以及身體健康
帝君殿：
供奉 關聖帝君 為忠義之神 警察們會供奉他來祈求破案！生意人把他當武財神供奉 學子亦跟他祈求功名因為帝君乃為五文昌帝君之一
三官大帝：天官堯 地官舜 水官禹 三官大帝為玉皇大天尊玄穹高上帝的得意助手任何要奏請玉皇上帝的事情都要先秉告給三官 天官賜福 地官赦罪 水官改厄 人們都要祈求他們賜福赦罪改厄！
地藏王菩薩：幽冥教主有廣大願力可祈求親人可以受到超度
月老殿：供奉月老星君很多單身男女都祈求月下老人可以賜與良緣！也很多情侶向月老祈求可以天長地久白頭偕老！
龍山寺還有太歲殿可以安太歲祈求一年可平安順遂還有功德堂供奉開山聖賢！日本人稱呼龍山寺為神明的百貨公司！神尊飛長多無法詳細的刊載只選擇裡面比較顯目的神尊來介紹